Thứ Năm, ngày 05 tháng Chín năm 2024, là ngày chót của Đức Thánh cha Phanxicô tại Indonesia. Ban sáng, Đức Thánh cha đến thăm Đền thờ Hồi giáo Istiqlal và gặp gỡ các vị lãnh đạo Hồi giáo tại đây và rồi ký Tuyên ngôn chung. Sau đó, Đức Thánh cha đến trụ sở mới của Hội đồng Giám mục Indonesia, lúc 10 giờ 15 để gặp gỡ những người nghèo, được các tổ chức bác ái Công giáo trợ giúp. Ban chiều cùng ngày, Đức Thánh cha đến Sân vận động Gelora Bung để cử hành thánh lễ cho các tín hữu vào lúc 5 giờ chiều.